Una de las actividades de la Fundación Española de Historia Moderna es la convocatoria de las Reuniones Científicas en las distintas universidades de España donde se estructura sobre la base de dos grandes secciones temáticas dentro del ámbito de la Historia Moderna con conferencias de apertura y de clausura. Las ponencias correspondientes a las dos secciones temáticas se celebrarán de forma simultánea. De esta manera, los comunicantes podrán agruparse en función de sus respectivas áreas de interés. Las ponencias marco correrán cargo de reputados especialistas en los temas concernidos.
Las Actas se publican tras su celebración, como principal actividad siempre en colaboración con Universidades y el CSIC y recibiendo el apoyo de múltiples entidades que han considerado de interés la realización de estos congresos modernistas.
Asimismo, la Fundación decidió avalar los cursos que siendo de temática modernistas se considerasen de altura suficiente como para considerarlos útiles científicamente.
Reuniones científicas celebradas:
I Reunión científica, Asociación española de historia moderna.
Madrid.1989.
Vol. I La España de Carlos IV.
Vol. II La emigración española a América.
II Reunión Científica, Asociación Española de Historia Moderna.
Moratalla (Murcia) 1992.
Vol. I, Política y hacienda en el antiguo régimen.
Vol. II. Mentalidad e ideología en el Antiguo Régimen.
III Reunión Científica, Asociación Española de Historia Moderna.
Las Palmas. 1994.
Vol. I Iglesia y sociedad en el antiguo régimen.
Vol. II El comercio en el Antiguo Régimen
IV Reunión Científica, Asociación Española de Historia Moderna
Alicante. 1996.
Vol. I. Monarquía, imperio y pueblos en la España moderna.
Vol. II. Disidencias y exilios en la España moderna.
V Reunión Científica, Asociación Española de Historia Moderna
Cádiz 1998.
Vol. I Felipe II y su tiempo.
Vol. II La Administración Municipal en la Edad Moderna.
VI R. Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Alcalá de Henares 2000.
Vol. I Carlos V y Felipe II: cambios dinásticos.
Vol. II Milenarismo, mesianismo y utopía.
VII Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Ciudad Real, 2002.
Vol. I La declinación de la Monarquía Hispánica en el siglo XVII.p.989
Vol. II El mundo rural en la España Moderna.p. 1408
VIII Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Madrid 2004.
Vol. I Isabel I y las Reinas de España: realidad, modelos e imagen historiográfica.
Vol. II El equilibrio de los imperios: De Utrecht a trafalgar.
IX Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Málaga 2006.
Vol. I Población y grupos sociales en el Antiguo Régimen
Vol. II Tradición versus innovación en la España Moderna.
X Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Santiago de Compostela 2008.
Vol. I El mundo urbano en el siglo de la Ilustración.
Vol. II El mar en los siglos modernos .
XI Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Granada 2010.
Vol. I El Estado absolutista y la Monarquía.
Vol. II Conflictividad y violencia en la Edad Moderna.
XII Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
León 2012.
Vol. I Campo y Campesinos en la España Moderna.
Vol. II Culturas políticas en el mundo hispano
XIII Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Sevilla 2014
XIV Reunión Científica, Fundación Española de Historia Moderna
Zaragoza 2016